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生信分析

来源:上海解颐生物作者:上海解颐生物发布时间:2018-05-10 09:43

 生物信息学(Bioinformatics)是一门交叉学科,它将计算机技术、统计学方法以及数学算法等应用到生物学研究当中。这门学科的产生也是一种必然趋势,毕竟测序技术发展那么快,分子生物学和遗传生物学的信息量爆炸式增长。举个简单的例子来说现在随便一个测序至少6个样本,每个样本3万个探针信息,全球那么多人做测序,这信息量就跟海一样,生物信息学就是为了把这海变成湖,变成池塘。另一方面,遗传学本身的信息量就很大,比如人类基因组有30亿对碱基,2.5万的基因,所以生物信息学的一个重要应用就是建立各种各样的数据库,来实现信息共享,毕竟一个人穷尽一生的精力可能也就研究几个基因,但是全球这么多人共同努力,这2.5万个基因就变得不那么难了。
那么我为什么要做生信分析——这个问题回答起来其实很简单,因为如果你做了一个芯片测序,你得到的是下面这些东西:



相信这应该不是你想要的结果吧?
你想知道的是应该是究竟是哪一个或者哪一群基因在某个生物学过程中起到了重要的作用,而要得到这样一个可信的结论,是需要进行重重的生物信息学分析的。
生物信息学分析大致可以分为三个境界
1、只会机械的套用已有的方法,对算法和原理一无所知,无法运用结果解释分析生物学问题;
2、了解生信检验的基本原理(作者在发明它时,最初的构想、原型、启发),可以根据实际情况选择不同的分析算法,采用最优解,能够解释生物学问题;
3、能够自由的组合、拼接已有的算法,必要时创造想要的算法

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